拓扑热不稳定性与蛋白质长度
生物大分子
2007-05-23 v1
摘要
我们分析了全局拓扑对与热浴热平衡的折叠蛋白结构稳定性的影响。对于一大类单结构域蛋白,我们在高斯网络模型(GNM)内计算了谐波谱并确定了谱维数——一个描述模密度低频行为的参数。我们发现谱维数与蛋白质氨基酸数目之间存在惊人的强关联。考虑到更大的谱维数值对应于拓扑上更紧密的折叠态,我们的结果表明,对于给定的温度和蛋白质长度,折叠结构对应于与热力学稳定性相容的较不紧密的折叠。
引用
@article{arxiv.q-bio/0405010,
title = {Topological thermal instability and length of proteins},
author = {R. Burioni and D. Cassi and F. Cecconi and A. Vulpiani},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0405010},
year = {2007}
}
备注
15 pages, 6 eps figures, 2 tables