描述生物聚合物中螺旋-线团转变的多肽链广义模型

在本文中，我们总结了单链（多肽）和双链（多核苷酸）大分子中螺旋-线团转变的理论研究结果。该 Hamiltonian 不包含任何专为螺旋-线团转变设计的参数，仅使用纯粹的分子微观参数。为了计算平均值，我们使用转移矩阵方法求得了配分函数。GMPC 允许基于统一的微观方法描述影响该转变的多种因素。由此我们得出：溶剂以不同方式改变转变温度和区间，这取决于溶剂类型以及溶剂与大分子相互作用的能量；在氢键背景下，堆积提高了稳定性并降低了熔化的协同性。对于异质 DNA，我们能够解析地推导出著名的转变温度和区间公式。在 GMPC 框架内，我们计算并展示了螺旋-线团转变的两个序参量——螺旋度和螺旋构象中重复单元的平均分数——之间的差异。