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螺旋-卷曲转变与蛋白质折叠中氢键形成的竞争

软凝聚态物质 2012-08-22 v2 统计力学 生物大分子

摘要

本文利用经过适当修改的广义多肽链模型,解析地研究了生物聚合物在能与溶剂形成氢键的显式溶剂(如水)中的螺旋-卷曲转变问题。除了常规的螺旋-卷曲转变外,在较低温度下还发现了一个额外的卷曲-螺旋或重入转变。重入转变源于聚合物-聚合物和聚合物-水氢键之间的竞争。两种氢键类型之间的平衡不仅可以通过温度变化,还可以通过压力、机械力、渗透压或其他外部影响来向任一方向移动。多肽和多核苷酸都在统一的形式体系下被考虑。我们的方法解释了实验上难以通过压力观察重入转变的原因,并强调了拉伸实验对DNA研究的优势。讨论了结果,并与近期多篇出版物中报道的结果进行了比较,获得了显著的一致性。

关键词

引用

@article{arxiv.1101.2861,
  title  = {Competition for hydrogen bond formation in the helix-coil transition and protein folding},
  author = {Artem Badasyan and Shushanik A. Tonoyan and Yevgeni Sh. Mamasakhlisov and Achille Giacometti and Albert S. Benight and Vladimir F. Morozov},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1101.2861},
  year   = {2012}
}

备注

21 pages, 3 figures, submitted to Phys Rev E