异聚物中构型复杂性对线团-球状相变的影响
软凝聚态物质
2022-09-07 v1 生物大分子
摘要
本文研究了异聚物链的线团-球状转变。通过大量的分子动力学模拟,我们表明该转变与链复杂性直接相关,而复杂性取决于环境中定义的化学物种数量以及结合位点沿聚合物的位置。此外,当物种数量增加时,我们发现结合位点的分布除了聚合物模型的标准控制参数(即结合物浓度与结合亲和力)之外,在触发转变中起着重要作用。总体而言,我们的结果表明,通过增加系统复杂性会涌现出新的组织层次,从而实现对聚合物热力学状态更具结构化的控制。这可潜在地应用于染色质结构的研究,因为此类聚合物模型已被广泛用于理解基因组折叠的分子机制。
引用
@article{arxiv.2209.01553,
title = {The effect of configurational complexity in heteropolymers on the coil-globule phase-transition},
author = {Fabrizio Tafuri and Andrea Maria Chiariello},
journal= {arXiv preprint arXiv:2209.01553},
year = {2022}
}