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受限弯曲对螺旋大分子相的稳定作用

生物物理 2015-09-23 v1 软凝聚态物质

摘要

通过针对螺旋聚合物的通用粗粒化模型进行广泛的副本交换模拟,我们系统地研究了在扭转势垒影响下,具有自相互作用的柔性和半柔性弹性聚合物向所有可能螺旋相的结构转变。竞争相互作用导致了多种构象相,包括无序螺旋排列、单螺旋以及有序的三级螺旋束。最引人注目的是,我们发现弯曲约束导致了螺旋相的清晰分离与稳定。这有助于理解为何诸如双链DNA的半柔性聚合物倾向于形成显著的螺旋结构,以及蛋白质常在其三级结构中展现出丰富的螺旋结构(如螺旋束)。

关键词

引用

@article{arxiv.1509.06454,
  title  = {Stabilization of helical macromolecular phases by confined bending},
  author = {Matthew J. Williams and Michael Bachmann},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1509.06454},
  year   = {2015}
}