DNA 小环中的螺旋破坏

本文利用路径积分技术研究 DNA 微环的热力学稳定性。互补链上碱基对之间的氢键可被热涨落破坏，而沿双螺旋的暂时性涨落开口对于遗传信息的转录和复制等生物功能至关重要。为了分析分子尺寸与螺旋破坏出现之间的相互作用，计算了可变半径圆形序列中的螺旋解旋和气泡形成模式。研究发现，螺旋破坏存在于碱基对数量 $< 100$ 的微环中，并表现为一种缓解由螺旋弯曲和扭转引起的应力的策略。