调控 DNA 解链泡成核以促进纳米生物传感
生物物理
2018-05-14 v1 软凝聚态物质
摘要
在严苛的生物传感环境中，改进筛选效率策略已成为具有重要意义的问题。含有 200 至 400 个碱基对、亦称 microDNA 的 DNA 微环是自然界中超螺旋 DNA 环的代表。其短小尺寸使它们极易发生 writhe 与 twist，而后者已知在 DNA 解链中起核心作用。我们研究了可诱导纳米尺度 DNA 解链泡并良好控制其长寿命的微环长度与超螺旋密度。介观建模与加速动力学模拟使我们能准确研究与长寿命解链泡成核及闭合机制相关的热力学与动力学性质。我们的结果为具有增强特异性 DNA 结合蛋白选择性的新型 DNA 生物传感器铺平了道路。
引用
@article{arxiv.1805.04287,
title = {Control of DNA denaturation bubble nucleation to advance nano-biosensing},
author = {François Sicard and Nicolas Destainville and Philippe Rousseau and Catherine Tardin and Manoel Manghi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1805.04287},
year = {2018}
}
备注
5 pages, 1 figure, and Supporting Information (8 pages, 3 figures). arXiv admin note: text overlap with arXiv:1803.03490