DNA呼吸与单链DNA结合蛋白的耦合动力学
生物大分子
2007-05-23 v2 统计力学
摘要
我们基于(2+1)维主方程,研究了在选择性结合单链DNA的蛋白质存在下,DNA分子中局部变性区的尺寸涨落。通过调节物理参数,我们可以将系统从无扰动的泡涨落驱动到由结合蛋白诱导的完全变性。我们确定了DNA泡的有效自由能景观,并探索了其弛豫模式。
引用
@article{arxiv.q-bio/0411053,
title = {Coupled dynamics of DNA-breathing and single-stranded DNA binding proteins},
author = {Tobias Ambjornsson and Ralf Metzler},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0411053},
year = {2007}
}
备注
REVTeX4, 4 pages, 5 figures, revised version