DNA 状态涨落对自调控基因单细胞动力学的影响
分子网络
2009-11-13 v1 定量方法
摘要
本文发展了一种动力学平均场理论，用于分析基因表达的随机单细胞动力学。通过显式考虑 DNA 状态涨落的非平衡和非绝热特征，推导了单细胞动力学的双时关联函数和响应函数。将该方法应用于自调控基因，预测了丰富的动力学现象，如弛豫时间的反常增加和关联的振荡衰减。定义为蛋白质数量中关联与响应之比的有效“温度”，在 DNA 状态变化频繁时较小，而在 DNA 状态变化不频繁时变大，表明后一种情况下噪声显著增强。
引用
@article{arxiv.0705.1389,
title = {Effects of the DNA state fluctuation on single-cell dynamics of self-regulating gene},
author = {Yurie Okabe and Yuu Yagi and Masaki Sasai},
journal= {arXiv preprint arXiv:0705.1389},
year = {2009}
}
备注
18 pages, 5 figures