闭合环状DNA中的螺旋-线团转变
生物大分子
2009-11-10 v1
摘要
提出了一个用于闭合环状DNA（ccDNA）的简化模型，以描述此类分子中螺旋-线团转变的一些具体特征。ccDNA的哈密顿量与先前为线性DNA引入的哈密顿量相关。基本假设是，氢键的约化能在转变过程中不是恒定的，而是有效地取决于已断裂键的比例。获得了一个转换公式，该公式将转变过程中给定螺旋度下ccDNA的温度与相同螺旋度下相应线性链的温度联系起来。该公式提供了一种简单的方法，可以根据具有相同核苷酸序列的线性DNA的实验熔解曲线来计算ccDNA的熔解曲线。
引用
@article{arxiv.q-bio/0401021,
title = {Helix-coil Transition in Closed Circular DNA},
author = {V. F. Morozov and Shura Hayryan and E. Sh. Mamasakhlisov and A. V. Grigoryan and A. V. Badasyan and Chin-Kun Hu},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0401021},
year = {2009}
}
备注
16 pages, 4figures