受限 DNA 熔解模型

DNA 分子受热时会发生变性。这一过程是局部发生的，从而形成熔化的单链 DNA 环，并由完整的双链 DNA 片段连接。这种“熔解”转变的性质已被深入研究。最近，由于测定了受限在纳米通道中的部分结合 DNA 的性质，人们对这一问题的兴趣激增。但是，这种受限如何影响熔解转变？为回答这一问题，我们引入并求解了一个模型，该模型首先忽略自回避效应，预测了受限如何影响简单模型系统的熔解转变。我们发现，通道越窄，转变越平滑。随后，通过 Monte-Carlo 模拟，我们表明 Incorporating 自回避的模型显示出定性相同的行为，且受限效应比理想情况更强。