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无序模型制备:润湿与DNA脱链的案例

统计力学 2007-05-23 v3 生物大分子

摘要

我们研究了遗传序列组成对双链DNA熔解温度的影响,采用了在润湿问题框架下提出的一些简单可解析模型。我们回顾了关于无序模型的前期工作,并求解了尚未存在解的情形。我们通过蒙特卡罗模拟和传递矩阵数值计算检验了所得解。我们提出数值证据表明,由于无序导致的临界温度对数修正效应,此前在RSOS模型中发现的现象,更广泛地适用于ASOS和连续模型。理论模型与实验数据之间的一致性表明,在此背景下,无序应是任何模型的关键因素,而其他方面可以保持非常简单,这种方法对更广泛的问题类别也具有应用价值。我们的工作还对DNA序列中是否存在关联性具有一定意义。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0511532,
  title  = {Modelling Disorder: the Cases of Wetting and DNA Denaturation},
  author = {Saul Ares and Angel Sanchez},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0511532},
  year   = {2007}
}

备注

Final published version. Title and discussion modified. 6 pages, 3 figures