DNA 熔解中碱基堆积与配对的统计力学模型
统计力学
2007-05-23 v1 生物物理
生物大分子
摘要
我们提出了一种统计力学模型，用于描述 DNA 熔解，其中碱基堆积和配对被明确地作为两个独立的自由度引入。与以往方法不同，本模型能够完整描述 DNA 二级结构在整个实验可达温度范围内的热变性。碱基配对通过 zipper 模型描述，碱基堆积通过 Ising 模型描述。我们 presented 了通过在较低 pH 下将堆积转变移至实验可达温度范围内获得的实验数据，这些测量结果确认了 Ising 模型方法确实是碱基堆积的良好描述。相比之下，与实验结果的比较表明，简单 zipper 模型对碱基配对的描述存在局限性。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0411563,
title = {Statistical mechanics of base stacking and pairing in DNA melting},
author = {Vassili Ivanov and Yan Zeng and Giovanni Zocchi},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0411563},
year = {2007}
}
备注
13 pages with figures