DNA 解链曲线中精细结构的起源
软凝聚态物质
2024-04-11 v1
摘要
借助一维随机 Potts-like 模型,我们研究了双链 DNA 微分解链曲线上观察到的精细结构的起源。我们通过比较随机、相关和嵌段序列的结果,评估了序列排列对 DNA 解链曲线的影响。我们的结果再次证实,对于所有类型的序列排列,精细结构随着链长的增加而模糊,并表明精细结构是一种有限尺寸效应。我们发现,在由具有序列相关性的嵌段组成的链中,精细结构更为持久,这可能是因为嵌段引入了增加的序列无序。许多天然 DNA 表现出明显的解链曲线精细结构。根据我们的结果,这可能意味着此类 DNA 中存在嵌段。精细结构的存在本身也可能意味着天然 DNA 在体内存在一个最优长度。
引用
@article{arxiv.2404.06822,
title = {Origins of Fine Structure in DNA Melting Curves},
author = {Arevik V. Asatryan and Albert S. Benight and Artem V. Badasyan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2404.06822},
year = {2024}
}
备注
15 pages, 9 figures, JCP submission