环状 DNA 的变性：超螺旋机制
统计力学
2011-11-22 v2 生物物理
摘要
通过扩展 Poland-Scheraga 模型以包含缠绕自由度，本文分析了环状 DNA 中发生的变性相变。我们考虑了均聚物的情形，其中由环变性释放的双链螺旋缠绕数被超螺旋吸收。我们发现，与线性 DNA 的情形一样，相变的阶数由环指数 决定。然而，线性 DNA 中 PS 模型在 时显示的一阶相变，在 趋近于 2 时被具有任意高阶的连续相变所取代；而线性情形下在 区域内发现的二阶相变则消失了。此外，我们的分析揭示，固定连接数下的熔化是一种凝聚相变，其中凝聚物为出现在临界温度以上的宏观环。
引用
@article{arxiv.1108.5444,
title = {Denaturation of Circular DNA: Supercoil Mechanism},
author = {Amir Bar and Alkan Kabakçıoğlu and David Mukamel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1108.5444},
year = {2011}
}
备注
9 pages, 4 figures