多正则算法研究螺旋-卷曲转变的热力学

通过最近提出的多正则算法研究氨基酸同源寡聚体中螺旋-卷曲转变的热力学。考虑了三种特征氨基酸——丙氨酸（螺旋形成者）、缬氨酸（螺旋无关者）和甘氨酸（螺旋破坏者）——的同源寡聚体，长度为10。为了考察长度依赖性，对丙氨酸还考虑了其他长度（15和20）。从一次具有完全随机初始构象的多正则生产运行中，我们获得了最低能量构象和各种热力学量（平均螺旋度、Zimm-Bragg $s$ 和 $\sigma$ 参数、螺旋态与卷曲态之间的自由能差等）作为温度的函数。结果证实了丙氨酸是螺旋形成者，缬氨酸是螺旋无关者，甘氨酸是螺旋破坏者。