气相中基于丙氨酸的多肽螺旋 - 线团转变研究
生物物理
2009-11-13 v1 化学物理
摘要
利用多正则系综模拟，作者研究了带电端基对基于丙氨酸的多肽中螺旋形成的影响。他们证实了早先的报道，即中性聚丙氨酸在气相模拟中表现出显著的螺旋 - 线团转变。在 C 末端引入带电的 Lys+ 会稳定螺旋并导致更高的转变温度。另一方面，在 N 末端添加 Lys+ 会抑制螺旋形成，取而代之的是发现了一种更球状的结构。这些结果与最近关于气相中基于丙氨酸的多肽的实验结果一致。它们表明，当前的力场能够准确描述蛋白质内的分子内相互作用。
引用
@article{arxiv.0711.4087,
title = {On the Helix-coil Transition in Alanine-based Polypeptides in Gas Phase},
author = {Y. Wei and W. Nadler and U. H. E. Hansmann},
journal= {arXiv preprint arXiv:0711.4087},
year = {2009}
}