聚合二肽丝氨酸二聚体二级结构转化的非平衡动力学
软凝聚态物质
2025-08-22 v1 化学物理
摘要
本文研究了丝氨酸二聚体聚合物结构崩溃的非平衡路径。为此，使用分子动力学模拟对丝氨酸二聚体从卷起结构向折叠结构的完整时间演化进行了研究。在转化开始时，短链 -卷起结构形成，似乎导致分子在折叠过程中变得更不规则。折叠完成后，-卷起结构的形成似乎成为导致形成螺旋簇的主要有序机制，这种结构代表了较长链的平衡行为。本文以两种与折叠相关的松弛时间的幂律标度作为函数探讨了该转化的动力学。
引用
@article{arxiv.2508.15547,
title = {Nonequilibrium Dynamics of the Helix-Coil Transition in Polyalanine},
author = {Maximilian Conradi and Henrik Christiansen and Suman Majumder and Fabio Müller and Wolfhard Janke},
journal= {arXiv preprint arXiv:2508.15547},
year = {2025}
}