重构加勒比海人群的群体遗传历史

加勒比海盆地是近期历史上先前分化的人类种群之间最复杂相互作用的家园之一。在此，利用全基因组 SNP 芯片数据，我们在次大陆层面上刻画了加勒比海人群的祖先成分，并揭示了区分岛屿与大陆加勒比海人群以及与其他西班牙裔/拉丁裔群体的精细种群结构模式。我们提供了遗传证据，证明岛屿人群中美洲原住民成分起源于南美内陆，并且在哥伦布到达之前加勒比海盆地存在广泛的基因流动。源自加勒比的欧洲成分显示出与亲本伊比利亚人群的显著分化，这可能是新世界殖民期间奠基者效应的结果。基于人口统计模型，我们重构了自大陆混合开始以来加勒比海复杂的种群历史。我们发现，岛屿人群最好被建模为吸收了两波非洲移民的混合体，这两波移民分别与跨大西洋奴隶贸易的早期和最高活动阶段相吻合。这两波移民似乎起源于西非的不同区域，在当今非裔加勒比人的基因组中留下了两种可区分的特征，从而揭示了奴隶贸易期间加勒比海动态过程的遗传影响。