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反应网络稳态簇的参数环面性

分子网络 2021-07-06 v2 计算机科学中的逻辑 符号计算

摘要

我们研究化学反应网络动力学中的实稳态簇。动力学采用具有参数化反应速率的质量作用动力学推导。所研究的模型本质上并非参数化的。相反,我们对参数的兴趣源于参数不确定性,因为反应速率通常测量精度有限或被估计。我们旨在检测环面性与平移环面性,使用近期针对实数与复数上非参数情形引入并研究的框架。环面性要求该簇指定底层域乘法群直幂的一个子群,而平移环面性仅要求一个陪集。在非参数情形下,这些要求构成了实判定问题。在存在参数的情况下,我们必须进一步推导参数满足环面性或平移环面性的充要条件。技术上,我们使用实量词消去方法。我们在生物网络上的计算再次确认平移环面性是一个相关概念,而环面性仅对退化参数选择成立。

关键词

引用

@article{arxiv.2105.10853,
  title  = {Parametric Toricity of Steady State Varieties of Reaction Networks},
  author = {Hamid Rahkooy and Thomas Sturm},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2105.10853},
  year   = {2021}
}

备注

Computations available as ancillary files