系统发育树的均值与方差
种群与进化
2018-05-14 v2 统计理论
统计理论
摘要
我们描述了在 Billera-Holmes-Vogtmann (BHV) 树空间中利用 Fréchet 均值与方差来总结和探索一组系统发育树多样性的方法。我们表明，Fréchet 均值与其他汇总方法具有可比性，并且尽管具有粘性，其成为二叉树的可能性仍高于多数规则一致树。我们证明，Fréchet 方差比常用的方差度量更快、更精确。Fréchet 均值与方差比以往此类估计量具有更充分的理论依据和更强的稳健性，且可以相当高效地进行估计，为构建更高级的统计方法奠定了基础，并可用于均值假设检验等应用。
引用
@article{arxiv.1708.00294,
title = {Mean and Variance of Phylogenetic Trees},
author = {Daniel G. Brown and Megan Owen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1708.00294},
year = {2018}
}
备注
26 pages, 12 figures; revisions include new dataset, improved exposition