化学动力学系统的线性共轭
代数几何
2021-10-27 v1
摘要
如果两个网络的动力学方程解可通过正线性变换相互转化,则称它们是线性共轭的。对化学动力学系统动力学等价的研究由 Craciun 和 Pantea 于 2008 年发起,并最终导出了线性共轭的 Johnston-Siegel 判据(JSC)。若干研究已应用混合整数线性规划(MILP)方法生成 MAK(质量作用动力学)系统、Bio-CRN(当网络限制为有向图时其为 hill 型动力学系统的子集)以及 PL-RDK(复因子可分解幂律动力学)系统的线性共轭。本研究给出一种通用计算方案,用于构造任意“速率常数-相互作用函数可分解”(RID)化学动力学系统的线性共轭,其中每个速率函数均为速率常数与相互作用函数的乘积。我们将 JSC 推广到 RID 动力学系统的复因子可分解(CF)子集,并证明任意非复因子可分解(NF)RID 动力学系统可通过变换与某 CF 系统动力学等价。我们证明,通过对变换为 CF 动力学系统的任意 NF 动力学系统应用 JSC,可为任意 RID 动力学系统生成线性共轭。
引用
@article{arxiv.1909.00533,
title = {Linear conjugacy of chemical kinetic systems},
author = {Allen L. Nazareno and Raymond Paul L. Eclarin and Eduardo R. Mendoza and Angelyn R. Lao},
journal= {arXiv preprint arXiv:1909.00533},
year = {2021}
}