离子介导的 RNA 结构坍缩：空间限域效应
生物物理
2015-06-15 v1 软凝聚态物质
化学物理
生物大分子
摘要
RNA 是 residing 于大分子拥挤细胞环境中的带负电荷分子。大分子限域会影响 RNA 折叠中的离子效应。在本工作中，利用最近开发的用于离子涨落和关联的紧束缚离子模型，我们研究了限域效应对简单模型系统中离子介导的 RNA 结构坍缩的影响。我们发现，对于 Na 和 Mg，空间结构限域显著增强了介导结构坍缩/折叠的离子效率。这种离子效率的增强归因于空间限制导致紧凑构象系综与（受限的）伸展构象系综之间的静电自由能差减小。
引用
@article{arxiv.1305.1154,
title = {Ion-mediated RNA structural collapse: effect of spatial confinement},
author = {Zhi-Jie Tan and Shi-Jie Chen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1305.1154},
year = {2015}
}
备注
22 pages, 5 figures