RNA 分支对病毒静电稳定的影响
生物物理
2016-08-10 v2 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
许多单链(ss)RNA 病毒由衣壳蛋白亚基和核酸自组装形成具有感染性的病毒粒子。人们认为带负电的 RNA 与带正电的病毒衣壳蛋白之间的静电相互作用驱动了封装过程,尽管越来越多的证据表明病毒 RNA 的序列也在包装中起作用。特别是,序列将决定 ssRNA 在溶液中可能采取的二级结构。在这项工作中,我们使用平均场理论来研究 RNA 的二级结构与静电相互作用如何结合从而影响组装效率以及组装后病毒粒子的稳定性。我们表明,RNA 的二级结构可能导致负的渗透压,而线性聚合物在相同条件下导致正的渗透压。这可能表明分支结构使 RNA 包装更有效,且病毒粒子更稳定。
引用
@article{arxiv.1605.04978,
title = {Effects of RNA branching on the electrostatic stabilization of viruses},
author = {Gonca Erdemci-Tandogan and Jef Wagner and Paul van der Schoot and Rudolf Podgornik and Roya Zandi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.04978},
year = {2016}
}