小 RNA 病毒的准平衡自组装
软凝聚态物质
2016-03-23 v2
摘要
我们提出了一种对小型单链(ss)RNA 病毒的准平衡自组装的描述,其衣壳蛋白(CPs)具有柔性的、带正电的无序尾,这些尾与带负电的 RNA 基因组分子结合。我们将此类病毒的组装描述为两个耦合的类似相变事件之间的相互作用:CPs 形成蛋白壳(衣壳)以及大型 ss 病毒 RNA 分子的缩合。CPs 之间的静电排斥与吸引性疏水相互作用以及由尾基介导的中和 RNA 片段之间的吸引相互作用相竞争。根据 CPs 之间以及 CPs 与 RNA 分子之间吸引相互作用的强度,推导出了一个组装相图。将其与近期病毒组装研究的结果进行了比较。我们证明,确实描述空衣壳组装的传统自组装理论,通常不适用于封装 RNA 的病毒粒子的自组装。
引用
@article{arxiv.1505.01224,
title = {Quasi-Equilibrium Self-Assembly of Small RNA Viruses},
author = {Robijn F. Bruinsma and Mauricio Comas-Garcia and Rees F. Garmann and Alexander Y. Grosberg},
journal= {arXiv preprint arXiv:1505.01224},
year = {2016}
}
备注
15 pages, 15 figures plus supplementary material 7 pages and 5 figures