聚合物周围病毒衣壳组装的机制
生物大分子
2015-05-18 v1
摘要
许多病毒的衣壳是在核酸或其他聚合物周围组装的。理解被包装聚合物的性质如何影响组装过程,可以促进预防病毒组装的生物医学努力或利用组装的纳米材料应用。为此,我们在格点上模拟了由数百到1000个亚基组成的闭合空心壳层围绕柔性聚合物的动态组装。我们发现,在最优聚合物长度(与衣壳表面积成比例)下组装效率最高;显著长于最优的聚合物通常会导致具有未包装聚合物“尾巴”的部分衣壳,或单个聚合物上多个部分衣壳之间的竞争。这些预测可以通过衣壳蛋白在同聚RNA或合成聚电解质周围组装的批量实验进行检验。我们还发现,聚合物可以通过稳定新亚基的添加和增强亚基的流入通量来提高生长中衣壳的亚基净积累速率;这些过程的影响可能通过监测单个衣壳组装的实验来区分。
引用
@article{arxiv.1002.3945,
title = {Mechanisms of viral capsid assembly around a polymer},
author = {Aleksandr Kivenson and Michael F. Hagan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1002.3945},
year = {2015}
}
备注
7 figures