球形病毒内包装的 RNA 基因组的径向分布

研究了球形病毒内包装 RNA 基因组的问题。病毒衣壳被建模为一个空心球。RNA 分子与内病毒衣壳之间的吸引力被假设为非特异性的，且仅发生在内衣壳表面。对于较弱的衣壳吸引力，发现 RNA 单体的浓度在衣壳中心处最大，以最大化其构象熵。对于较强的衣壳吸引力，RNA 浓度在靠近衣壳的某个距离处达到峰值。在后一种情况下，RNA 二级结构的分支与其向内衣壳的吸附之间的竞争导致衣壳表面附近形成致密的 RNA 层。该层的厚度是衣壳内半径的缓慢变化（对数）函数。因此，对于 RNA-衣壳相互作用的即时强度，病毒内包装的 RNA 量与衣壳面积（或蛋白质数量）成正比，而非与其体积成正比。数值剖面合理地描述了各种病毒中实验观测到的 RNA 核苷酸浓度剖面。