RNA病毒组装动力学的生成树模型
生物物理
2021-02-09 v1 软凝聚态物质
摘要
我们提出了一个用于小型单链RNA病毒组装的简单动力学模型，可用于在不同类型RNA分子之间进行解析性包装竞争。RNA选择机制纯属动力学性质，并基于组装能量曲线之间的微小差异。赢得这些包装竞争的RNA分子的特征在于具有最小的“最大阶梯距离”和最大的“包裹数”。前者是度量基因组分子“分支性”的拓扑不变量，而后者度量基因组分子与衣壳蛋白最大程度结合的能力。该模型还可用于研究成核与生长理论对病毒组装的适用性，随着RNA-蛋白质相互作用强度的增加，该理论不再适用。
引用
@article{arxiv.2102.03941,
title = {The Spanning Tree Model for the Assembly Kinetics of RNA Viruses},
author = {Inbal Mizrahi and Robijn Bruinsma and Joseph Rudnick},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.03941},
year = {2021}
}
备注
18 pages, 25 figures