受限和拥挤对模型蛋白质折叠的影响
生物大分子
2008-12-01 v1
摘要
我们对放置在半径为 R 的软排斥球内的 crambin 简单粗粒化模型进行了分子动力学模拟。受限使得在最佳温度下的折叠变慢并影响折叠路径，但这两种影响都不显著。通过在球内放置多个相同的蛋白质、使其变性然后监测其重折叠，研究了拥挤对折叠的影响。如果蛋白质之间的相互作用由排除体积效应主导，则净折叠时间基本上与单个蛋白质相同。引入蛋白质间的吸引接触会在吸引力强度超过单蛋白质接触强度值的大约一半时阻碍折叠。吸引力强度越大，发生聚集和错误折叠的可能性就越大。
引用
@article{arxiv.0811.4581,
title = {Effects of confinement and crowding on folding of model proteins},
author = {M. Wojciechowski and Marek Cieplak},
journal= {arXiv preprint arXiv:0811.4581},
year = {2008}
}