均匀物种形成模型下的分支长度和系统发育多样性分布
概率论
2011-08-01 v1
摘要
恒定速率生灭过程是物种形成和灭绝的常用零模型。如果移除灭绝和未采样的谱系，该过程会诱导出描述现存谱系之间关系的“重建树”。我们推导了重建树中随机选取的悬垂边长度的概率密度。对于完全采样下的纯生过程特例，我们还给出了内部边长度、从根出发的边长度以及多样性（所有边长之和）的概率密度。结果表明，结果依赖于重建树是以叶子数、年龄还是两者为条件。
引用
@article{arxiv.1107.5926,
title = {Distribution of branch lengths and phylogenetic diversity under homogeneous speciation models},
author = {Tanja Stadler and Mike Steel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1107.5926},
year = {2011}
}