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离散状态空间化学反应网络中的灭绝事件条件

动力系统 2017-01-11 v2

摘要

我们研究具有离散状态空间的化学反应网络,例如标准的连续时间马尔可夫链模型,并给出了保证系统出现灭绝事件的网络结构充分条件。我们推导的条件涉及创建一个称为支配扩展反应网络的修正化学反应网络,然后检查该网络的性质。我们将结果应用于若干网络,包括大肠杆菌中的 EnvZ-OmpR 信号通路。该分析产生了一个等式和不等式系统,与先前关于灭绝事件的结果相比,该系统允许算法实现。这种实现将在另一篇配套论文中研究,其中结果将应用于欧洲生物信息学研究所 BioModels 数据库中的 458 个模型。

关键词

引用

@article{arxiv.1701.02012,
  title  = {Conditions for Extinction Events in Chemical Reaction Networks with Discrete State Spaces},
  author = {Matthew D. Johnston and David F. Anderson and Gheorghe Craciun and Robert Brijder},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1701.02012},
  year   = {2017}
}

备注

26 pages, 1 figure