一种计算癌症基因突变间超越成对相关性的$p$值的精确方法
定量方法
2015-05-20 v1 基因组学
摘要
在癌症基因组分析中,癌症基因突变间互斥相关性的日益增多的观测是识别驱动事件或通路的关键组成部分。在此我们报告一种严格的统计方法,通过枚举跨越两个以上基因的重叠突变的零分布,来计算癌症基因突变间超越成对的互斥或共发生关系的精确值。我们方法的有效性和优势通过在癌症基因突变和模拟数据中与置换检验的比较得到明确证明。
引用
@article{arxiv.1505.04828,
title = {An exact method to compute a $p$-value for the beyond-pairwise correlations among cancer gene mutations},
author = {Jaegil Kim and Atanas Kamburov and Michal Lawrence and Yosef Maruvka and Gad Getz},
journal= {arXiv preprint arXiv:1505.04828},
year = {2015}
}