利用体细胞突变数据检验肿瘤克隆相关性

癌症病理学家的重大挑战是确定癌症患者的新肿瘤是转移还是疾病的独立发生。近年来，许多研究评估了肿瘤标本对，以检查肿瘤体细胞特征的相似性并检验克隆相关性。随着突变检测领域的演进，已开发出多种确定克隆性的统计方法，特别是用于比较候选标记物的杂合性缺失，以及比较拷贝数谱。越来越多的肿瘤正通过使用基因测序技术评估候选基因组的单点突变。对肿瘤对的突变谱进行比较带来了不同寻常的方法学挑战：某些位点的突变远比其他位点常见；对于可能发生突变的大多数位点，边际突变概率的知识匮乏；潜在突变谱的样本空间巨大。我们考察此问题并提出了一种用于检验同一患者一对肿瘤克隆相关性的检验。通过模拟，其性质被证明是有前景的。该方法使用文献中的若干例子进行说明。