基于样本空间任意排序的精确条件 p 值：在全基因组关联研究中的应用
统计方法学
2015-05-14 v1
摘要
我们提出了一种计算方法，用于在单个双等位基因遗传位点检测基因型 - 表型关联时，计算精确的条件效率稳健枚举 p 值。我们的方法可基于任意排序的检验统计量，例如效率稳健检验统计量或渐近 p 值。所得的 p 值为精确条件枚举 p 值，并满足基本的统计有效性性质。在实际应用中，该方法允许在个体双等位基因遗传位点的遗传模式未知的情况下，进行具有统计有效性的显著性检验——这是全基因组关联研究中的典型情况。我们提供了实现该方法的开源 R 代码。
引用
@article{arxiv.1307.7537,
title = {Exact conditional p-values from arbitrary ranking of a sample space: An application to genome-wide association studies},
author = {Max Moldovan and Mette Langaas},
journal= {arXiv preprint arXiv:1307.7537},
year = {2015}
}