若干癌症基因组数据的并发拓扑
应用统计
2017-09-07 v1 定量方法
摘要
将拓扑数据分析方法“并发拓扑”应用于胶质母细胞瘤数据中 69 个基因的突变频率。在维度 1 上发现了一些明显的“互斥性”。通过模拟具有与数据中发现的近似相同的二阶依赖结构的数据，似乎存在一个突变三元组 PTEN、RB1、TP53 表现出互斥性，该互斥性依赖于三阶依赖的特殊特征，并可能反映更大基因组的全局依赖。自助法分析表明，这种互斥形式在抽取该数据的总体中并不罕见。
引用
@article{arxiv.1709.01753,
title = {Concurrence Topology of Some Cancer Genomics Data},
author = {Steven P. Ellis},
journal= {arXiv preprint arXiv:1709.01753},
year = {2017}
}
备注
10 pages, 1 figure