Watson-Crick配对、Heisenberg群与Milnor不变量
生物大分子
2008-09-19 v1 群论
几何拓扑
摘要
我们利用链环的Milnor不变量研究了由无伪结的Watson-Crick配对决定的RNA二级结构。我们聚焦于第一个非平凡不变量,称之为Heisenberg不变量。Heisenberg不变量是一个整数,可以用Heisenberg群以及格路径来解释。我们证明了Heisenberg不变量给出了RNA二级结构中未配对碱基数量的下界。我们还证明了Heisenberg不变量可以预测RNA的变构结构。即,如果Heisenberg不变量很大,那么对于发现的Watson-Crick配对数量,存在广泛分离的局部极大值(即变构结构)。
引用
@article{arxiv.0809.3110,
title = {Watson-Crick pairing, the Heisenberg group and Milnor invariants},
author = {Siddhartha Gadgil},
journal= {arXiv preprint arXiv:0809.3110},
year = {2008}
}
备注
18 pages; to appear in Journal of Mathematical Biology