拓扑复杂性、接触阶数与蛋白折叠速率
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
通过蒙特卡洛模拟，发现两类二态折叠蛋白的相对接触阶数参数（CO）与折叠时间t之间存在显著相关性，该相关性在链长数值为N≥54且接触阶数CO>0.17的较长链上更为明显。对于N=80的情况，相关性尤为强烈，这对应于较慢且更复杂的折叠动力学学。这些结果在质地上与实验数据相符，其中在41至154个氨基酸的蛋白序列中，确实观察到t随CO的增加而增大的总体趋势。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0205631,
title = {Topological complexity, contact order and protein folding rates},
author = {P. F. N. Faisca and R. C. Ball},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0205631},
year = {2007}
}
备注
6 pages, 14 figures