APOBEC3 诱导突变在猴痘病毒差异进化中的作用
种群与进化
2026-05-12 v1 统计力学
基因组学
定量方法
摘要
近期研究表明，与早期收集的猴痘病毒（MPXV）基因组相比，新采样的 MPXV 基因组表现出与载脂蛋白 B mRNA 编辑催化多肽样 3（APOBEC3）介导的编辑一致的突变。目前尚不清楚这些单核苷酸多态性（SNPs）是源于 APOBEC3 诱导的编辑，还是一个或多个 MPXV 动物宿主内遗传漂变的结果。我们基于广义通用时间可逆（GTR）模型开发了一种简单方法，表明所观察到的 SNPs 很可能是 APOBEC3 诱导编辑的结果。该统计特征使我们能够提取谱系信息并估计进化事件。
引用
@article{arxiv.2308.03714,
title = {The role of APOBEC3-induced mutations in the differential evolution of monkeypox virus},
author = {Xiangting Li and Sara Habibipour and Tom Chou and Otto O. Yang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2308.03714},
year = {2026}
}
备注
22 pages, 7 figures, Supplement