对称 CTL 攻击下宿主内 HIV 谱系的合并
种群与进化
2011-08-04 v1 概率论
摘要
细胞毒性 T 淋巴细胞（CTLs）是免疫系统细胞，被认为在控制 HIV 感染中发挥重要作用。我们开发了一个 HIV-CTL 相互作用的随机 ODE 模型，该模型扩展了当前的确定性 ODE 模型。基于这个随机模型，我们考虑了 CTL 攻击对宿主内 HIV 谱系的影响，假设 CTL 以同等强度攻击多个表位。在此设定下，我们引入了随机 ODE 的一个极限版本，并证明在该极限下，HIV 谱系的合并可以用一个简单的颜料盒构造来描述。通过数值实验，我们表明，当 HIV 种群规模处于其假设范围的低端时，极限随机 ODE 下的结果准确地反映了 CTL 攻击下的 HIV 谱系。当前的 HIV 谱系构建技术依赖于 Kingman 合并。我们的结果给出了 CTL 攻击与 HIV 谱系之间的显式联系。
引用
@article{arxiv.1108.0686,
title = {The Coalescence of Intrahost HIV Lineages Under Symmetric CTL Attack},
author = {Sivan Leviyang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1108.0686},
year = {2011}
}