早期细胞毒性 T 淋巴细胞反应塑造的 HIV-1 选择性清除的计算推断方法
种群与进化
2012-08-16 v1
摘要
本研究基于广为人知的标准模型，开发了一种急性 HIV 感染的随机模型，该模型能够模拟 HIV 逃逸多种细胞毒性 T 淋巴细胞（CTL）反应的复杂突变路径。在此模型下，我们描述了两种计算推断方法：其一，采用贝叶斯方法构建模型参数的后验分布；其二，利用假设检验确定模型与数据的拟合程度。将这些方法应用于两个 CHAVI 数据集，结果表明，在分析 CTL 反应下的 HIV 动力学时，必须考虑多种突变变体之间的相互作用以及多向选择的重要性。
引用
@article{arxiv.1208.2981,
title = {Computational Inference Methods for HIV-1 Selective Sweeps Shaped by Early Cytotoxic T-Lymphocyte Response},
author = {Sivan Leviyang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1208.2981},
year = {2012}
}