量化 HIV-1 病毒进入对受体与辅受体表达的敏感性
定量方法
2018-05-10 v1 分子网络
亚细胞过程
摘要
许多病毒的感染始于病毒与细胞膜的融合，随后病毒内容物进入靶细胞，并最终经过许多生化步骤将病毒 DNA 整合入宿主细胞 DNA。膜融合与病毒衣壳进入的早期步骤由细胞表面吸附以及受体和辅受体结合所介导。HIV-1 特异性靶向人类免疫系统的 CD4+ 辅助 T 细胞，并在融合启动前与受体 CD4 和辅受体 CCR5 结合。先前已使用可独立控制 CD4 与 CCR5 浓度的细胞系（293-Affinofile）进行实验。在暴露于不同毒株的 HIV-1 后，通过感染细胞的比例测量所得感染力。为设计和评估靶向抑制进入过程的药物治疗的有效性，需要 CD4/CCR5 浓度与感染力之间准确的函数关系，以更定量地分析实验数据。我们提出三个动力学模型来描述 HIV 进入中可能的机制过程，并将其预测拟合到感染力测量值，对比并比较不同结果。我们的方法允许在不同毒株 HIV-1 的感染力在机制动力学参数空间中的聚类进行解释。我们的模型拟合还允许推断受体与辅受体结合的非平凡化学计量比，并提供一个框架以定量研究融合抑制剂与中和抗体的有效性。
引用
@article{arxiv.1805.03281,
title = {Quantifying the Sensitivity of HIV-1 Viral Entry to Receptor and Coreceptor Expression},
author = {Bhaven Mistry and Maria R. D'Orsogna and Nicholas E. Webb and Benhur Lee and Tom Chou},
journal= {arXiv preprint arXiv:1805.03281},
year = {2018}
}
备注
13 pages, 12 figures