准连锁平衡内外的统计遗传学（扩展版）

本综述关于统计遗传学，它是统计物理与群体生物学之间的交叉课题。焦点为准连锁平衡（QLE）阶段。我们此处的目标是澄清在群体生物学中何种条件下可预期 QLE 阶段成立，以及 QLE 阶段的稳定性如何丧失。QLE 态与统计力学中的热平衡态有许多相似之处，由 M Kimura 针对双位点双等位基因模型发现，并被（Neher and Shraiman, 2011）扩展和推广到全基因组尺度。我们所称的 Kimura-Neher-Shraiman（KNS）理论描述了由于突变、重组、自然选择以及可能的遗传漂变而进化的群体。当重组率和/或突变率相对于选择强度足够高时，存在 QLE 阶段。我们展示了在 QLE 中如何可能从群体基因型（动态）分布的知识推断适应度函数的上位性参数。我们进一步考虑在足够高选择强度下 QLE 机制的崩溃。我们回顾了选择-突变和选择-重组动力学的近期结果。最后，我们识别并刻画了一个称为非随机共存（NRC）的新阶段，其中变异性在群体中持续而不固定或消失。