简单与复杂适应度地形中的适应
种群与进化
2007-07-26 v1 统计力学
摘要
这是关于无性种群确定性突变-选择模型(即准物种理论)及相关主题的引介性综述。首先介绍适应度、突变和序列空间的基本概念。定义了不同类型的突变-选择动力学,并概述其与统计物理问题的关系。随后详细讨论简单单峰适应度地形中的平稳种群分布,特别强调错误阈值现象。简要描述了该理论的扩展,涵盖如上位性相互作用、二倍体生物、半保留复制和时变适应度峰等。进一步一节致力于随机崎岖适应度地形,其可呈现不同程度的适应度相关性以及延伸的中性网络。最后两节探讨崎岖与平滑适应度地形中的进化动力学,并简要概述相关实验。
引用
@article{arxiv.q-bio/0508008,
title = {Adaptation in simple and complex fitness landscapes},
author = {Kavita Jain and Joachim Krug},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0508008},
year = {2007}
}
备注
To appear in "Structural approaches to sequence evolution: Molecules, networks and populations", ed. by U. Bastolla, M. Porto, H.E. Roman and M. Vendruscolo