适应度景观上进化轨迹的统计物理学
种群与进化
2014-10-08 v1 统计力学
摘要
多维非线性景观上的随机游走在科学和工程的许多领域都备受关注。特别是，适应度景观上适应性轨迹的性质决定了种群的命运，因此在进化理论中起着核心作用。适应度景观的地形及其对进化动态的影响已在文献中得到广泛研究。我们将综述该领域当前的研究知识，重点关注最近发展起来的一种系统方法，用于表征路径长度、平均首次通过时间以及路径系综的其他统计量。这种方法基于统计物理学的通用技术，适用于任意复杂性和结构的景观。它特别适合量化随机轨迹的多样性和进化事件的可重复性。我们利用一个蛋白质进化的生物物理模型来演示该方法，该模型描述了蛋白质在进化新功能的同时如何维持稳定性。
引用
@article{arxiv.1305.1352,
title = {Statistical Physics of Evolutionary Trajectories on Fitness Landscapes},
author = {Michael Manhart and Alexandre V. Morozov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1305.1352},
year = {2014}
}