复杂适应度景观的临界性质
种群与进化
2010-12-17 v1 分子网络
摘要
进化适应是增加种群对其所处适应度景观适应度的过程。因此,进化动力学受到该适应度景观的塑造、约束和引导。已有大量工作致力于理解适应种群的进化动力学,但对景观结构的了解则少得多。在此,我们研究了描述蛋白质折叠或形成通路或模块的相互作用基因集合的相互作用位点的复杂适应度景观的全局和局部结构。我们发现,在这些景观中,高峰更可能出现在其他高峰附近,这证实了 Kauffman 的“中央高原”假说。我们研究了作为景观崎岖度函数的峰簇,并发现这种聚类使得峰能够形成相互连接的网络。这些网络作为最小峰高的函数经历渗流相变,这表明从一个峰转移到另一个峰所需突变不超过两次的进化轨迹可以跨越整个遗传空间。这些网络对崎岖景观中的进化具有启示意义,使得在局部适应度峰被攀登后适应过程能够继续进行。
引用
@article{arxiv.1006.2908,
title = {Critical properties of complex fitness landscapes},
author = {Bjørn Østman and Arend Hintze and Christoph Adami},
journal= {arXiv preprint arXiv:1006.2908},
year = {2010}
}
备注
7 pages, 6 figures, requires alifex11.sty. To appear in Proceedings of 12th International Conference on Artificial Life