有效势揭示复杂适应度地形中的进化轨迹
种群与进化
2019-12-13 v1 统计力学
摘要
在分子和微生物系统中测量适应度地形的努力日益增多,其前提在于地形地貌与进化轨迹之间的紧密关系。然而,这一关系远非直截了当:根据其突变率的不同,达尔文种群可以爬上最近的适应度峰值(适者生存),定居于具有更高突变稳健性的较低区域(平者生存),或完全无法适应(错误灾变)。这些分岔凸显进化并不必然如 Wright 所设想的那样驱动种群“从较低峰值走向较高峰值”。因此问题依然存在:复杂地形究竟如何约束进化,我们能否预测其下一步去向?本文引入准物种理论的推广,将亚稳态进化状态识别为有效势的极小值。由该表示出发,我推导出一个粗粒化的马尔可夫状态模型,进而构成在广泛突变率范围内进行进化预测的基础。由于有效势与量子哈密顿量的基态相关,我的方法或可激发进化动力学与量子多体理论之间富有成果的交互。
引用
@article{arxiv.1912.05890,
title = {Effective potential reveals evolutionary trajectories in complex fitness landscapes},
author = {Matteo Smerlak},
journal= {arXiv preprint arXiv:1912.05890},
year = {2019}
}
备注
Cross-posted on bioRxiv