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在系谱树上观测到的生长 - 分裂模型的统计估计

概率论 2015-05-29 v2 统计理论 定量方法 统计理论

摘要

我们通过分段确定性 Markov 分支树对细胞种群的生长进行建模。每个细胞以依赖于其大小xx的分裂率B(x)B(x)分裂成两个后代。每个细胞的大小随时间呈指数增长,其增长率因个体而异。我们表明,如果在状态变量中同时按大小和增长率进行结构化,该模型的平均经验测度满足生长 - 分裂型方程。我们基于对系谱树上不同大小为nn的抽样方案的种群观测,构建了分裂率B(x)B(x)的非参数估计量。我们的估计量在渐近意义下几乎达到了平方损失误差中的ns/(2s+1)n^{-s/(2s+1)}速率。当假设每个细胞的增长率相同时,我们恢复了经典的生长 - 分裂模型,并且我们的估计量改进了通过间接观测方案在\cite{DHRR, DPZ}中获得的ns/(2s+3)n^{-s/(2s+3)}速率。我们的方法经过了数值一致性测试,并应用于{\it Escherichia coli}数据。

关键词

引用

@article{arxiv.1210.3240,
  title  = {Statistical estimation of a growth-fragmentation model observed on a genealogical tree},
  author = {Marie Doumic and Marc Hoffmann and Nathalie Krell and Lydia Robert},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1210.3240},
  year   = {2015}
}

备注

46 pages, 4 figures