化学反应网络的定性动力学：基于部分热带平衡的研究
分子网络
2022-05-17 v1 符号计算
动力系统
摘要
我们讨论一种用符号动力学描述化学反应网络定性动力学的方法。该方法可应用于具有分离时间尺度的质量作用反应网络，利用部分热带平衡问题的解作为符号状态的代理。部分热带平衡解是经算法求得的。这些解还提供了慢-快分解与模型降维所需的缩放。因此，模型的任意轨迹均可表示为全模型的局部近似序列。我们以细胞周期的生化模型为案例说明了该方法。
引用
@article{arxiv.2205.07360,
title = {Qualitative dynamics of chemical reaction networks: an investigation using partial tropical equilibrations},
author = {Aurélien Desoeuvres and Peter Szmolyan and Ovidiu Radulescu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2205.07360},
year = {2022}
}
备注
23 pages, 5 figures, submitted to CMSB 2022