生化网络的热带几何与动力学：在混合细胞周期模型中的应用
分子网络
2011-09-21 v2 代数几何
摘要
我们利用Litvinov-Maslov对应原理来约化和杂交化生化反应网络。我们将此方法应用于细胞周期振荡器模型。约化并杂交化的模型可作为细胞周期的混合模型。我们还提出了一个检测具有有理速率函数的生化模型中准平衡（QE）反应和准稳态（QSS）物种的实用方法，并将此方法用于模型约化。有趣的是，光滑模型的QE/QSS不变流形及其上的约化动力学，可以分别与杂交化的热带簇及其上的滑模相对应。
引用
@article{arxiv.1109.4085,
title = {Tropical geometries and dynamics of biochemical networks. Application to hybrid cell cycle models},
author = {Vincent Noel and Dima Grigoriev and Sergei Vakulenko and Ovidiu Radulescu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1109.4085},
year = {2011}
}
备注
conference SASB 2011, to be published in Electronic Notes in Theoretical Computer Science