化学反应网络的半定量抽象与分析
系统与控制
2019-05-27 v1 性能
分子网络
摘要
大型连续时间随机系统的分析是一项计算密集的任务。在这项工作中，我们关注由化学反应网络（CRNs）产生的人口模型，其在生化系统的分析与设计中起着基础作用。许多相关的 CRNs 由于包括随机性、刚性和多峰人口分布在内的复杂动力学而对现有技术尤其具有挑战性。我们提出了一种新方法，不仅能够预测，而且能够解释瞬态和稳态行为。它侧重于行为的定性描述，并仅旨在数量级上达到定量精度。首先，我们将 CRN 抽象为一个紧凑模型，保留粗略的时间信息，仅区分显著不同的人口，但捕获相关的行为序列。其次，我们通过最可能转移近似分析模型的最可能时间行为。正如文献中复杂 CRNs 所展示的，我们的方法重现了已知结果，但与最先进的方法相比，它以几乎零计算成本运行，从而提供了前所未有的可扩展性。
引用
@article{arxiv.1905.09914,
title = {Semi-Quantitative Abstraction and Analysis of Chemical Reaction Networks},
author = {Milan Češka and Jan Křetínský},
journal= {arXiv preprint arXiv:1905.09914},
year = {2019}
}